L'église de Santiago ou des pèlerins est de style gothique primitif. À l'intérieur est conservée la cloche de l'ancien ermitage de San Salvador de Ibañeta dont le son guidait les pèlerins les jours de brouillard. A ses côtés se trouve la chapelle du Saint-Esprit (XIIe), aussi appelée "silo de Charlemagne", car ce fut une halle à grains pour ses armées. Il s'agit du bâtiment le plus ancien de la Collégiale. Selon la tradition c'est ici que serait enterré certains Preux, dont Roland de Roncevaux.